打井抽水的原理在大气压力的作用下，循环液由沉淀池经回水沟沿着井孔的环状间隙流到井底，此时转盘驱动钻杆，带动钻头旋转进行钻进，由泥浆泵抽吸建立的负压把碎屑泥浆吸入钻杆内腔，随后上升至水，经泥浆泵排入沉淀池，沉淀后的循环液继续流入井孔，如此周而复始，形成了反循环的钻进工作。
打井机机结构形式牵引式、车载式、车载背机式。一般打井机的组成：柴油机、摩擦离合器、变速箱、分动箱、传动轴、泥浆泵、清水泵、真空泵、转盘、卷扬机、液压系统、操纵机构、桅杆、钻具、车架等。
毕竟地底不是致密的结构，有着相当大的余地可以容纳水。而雨雪天气以后，水一部分蒸发，另一部分就渗入地下，还有附近河流的渗入等。打井抽水是经过地下沙石的层层过滤，以及自然的沉淀，打出来的就是清水了。当然，水质取决于周围土壤河流受污染程度。