对水轮机进行优化设计和调试是降低水电机组噪声的重要手段之一。合理设计叶轮形状、叶片数量、叶片倾角等参数，以减少水流冲击和振动产生的噪音；在水轮机转速、叶片角度等操作参数的选择上，也需要充分考虑噪声控制的因素，尽量降低噪音产生。
发电机也是水电机组噪声的重要来源之一。通过采用减振、隔声支架等技术手段，可以有效减少发电机在运行时的振动噪声，同时选择低噪声、高效率的发电机也能够降低整体噪声水平。
对水电机组运行中的管道、阀门、冷却系统等附属设施进行维护和管理，也能有效降低机组运行时产生的噪音。定期检查和维护水泵、阀门等设备，确保其正常运行和密封性能，减少水流冲击和流体振动引起的噪音。
在机房的建造和环境布置上，也需要考虑噪声控制的因素。采用吸音材料、隔音墙体等措施，减少机房内的噪音传播和反射；合理设置通风系统、消声器等设备，降低机房内的噪音污染。
